cmtk-dwi_mask_bad_slices - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

dwi_mask_bad_slices - Encontre cortes ruins em um conjunto de imagens ponderadas por difusão.

SINOPSE

dwi_mask_bad_slices DifusãoImagePaths

DESCRIÇÃO

Esta ferramenta lê um conjunto de imagens de RM ponderadas por difusão 3D e encontra cortes ruins. Uma fatia ruim
em uma imagem de difusão é detectado como aquele cuja intensidade média está fora de um especificado
intervalo em torno da média das médias de todas as fatias correspondentes do restante
imagens de difusão.

OPÇÕES

Global Kit de ferramentas Opções (estes e guarante que os mesmos estão compartilhado by todos os CMTK Ferramentas)
--Socorro
Grave uma lista de opções básicas de linha de comando na saída padrão.

--ajuda-tudo
Escreva uma lista completa de opções de linha de comando básicas e avançadas na saída padrão.

--wiki
Escreva uma lista de opções de linha de comando para a saída padrão na marcação MediaWiki.

--cara
Grave o código-fonte da página de manual na marcação 'nroff' para a saída padrão.

--versão
Grave a versão do kit de ferramentas na saída padrão.

--eco
Grave a linha de comando atual na saída padrão.

--nível detalhado
Defina o nível de verbosidade.

--verbose, -v
Aumentar o nível de detalhamento em 1 (obsoleto; com suporte para compatibilidade com versões anteriores).

--tópicos
Defina o número máximo de threads paralelos (para threads POSIX e OpenMP).

Entrada Opções
--b0count
Número de imagens b = 0 no início da lista de imagens. Estes não estão incluídos em
a detecção de fatia ruim ou mascaramento, mas também são gravados no diretório de saída para
conveniência. Supõe-se que todas as imagens b = 0 estão no início da lista de
imagens de entrada, mas não no final ou no meio. [Predefinição: 0]

- orientação do corte
Defina a orientação da fatia das imagens de difusão. Valores suportados: "axial",
"sagital", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", onde o padrão é "axial",
ou use um dos seguintes:

--axial
Fatias axiais [Este is que o predefinição]

--sagital
Fatias sagitais

--coronal
Fatias coronais

--fatia-x
O eixo da coordenada X é a direção da fatia

--fatia-y
O eixo da coordenada Y é a direção da fatia

--fatia-z
O eixo da coordenada Z é a direção da fatia [Este is que o predefinição]

Mau Fatia Detecção
--stdev
Limiar para identificação de corte ruim em unidades de desvios padrão de intensidade ao longo
todas as fatias correspondentes das imagens de difusão restantes. [Predefinição: 3]

saída Opções
--converter para
Tipo de dados escalar para as imagens de saída. Se seu valor de preenchimento for negativo, mas seu
dados de entrada não assinados, por exemplo, certifique-se de selecionar um tipo de dados assinados para o
saída. Por padrão, o tipo de dados de saída é igual ao tipo de entrada. Suportado
valores: "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" ou use
um dos seguintes:

--Caracteres
8 bits, assinado

--byte
8 bits, sem sinal

--baixo
16 bits, assinado

--horizontal
16 bits, sem sinal

--int
32 bits assinados

- uint
32 bits sem sinal

--flutuador
Ponto flutuante de 32 bits

--Duplo
Ponto flutuante de 64 bits

--valor de preenchimento , -p
Valor de preenchimento para substituir os dados de cortes defeituosos detectados nas imagens de saída. [Predefinição: -1]

--diretório de saída , -o
Caminho do sistema de arquivos para gravar imagens com fatias ruins mascaradas (ou seja, preenchidas com um
valor de preenchimento). [Predefinição: NENHUM]

AUTORES

Torsten Rohlfing, com contribuições de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Use cmtk-dwi_mask_bad_slices online usando serviços onworks.net