Este é o comando complexe que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
complexo - Encontre a complexidade linguística em sequências de nucleotídeos
SINOPSE
integrações -seqüência sequência -lwin número inteiro -degrau número inteiro -jmin número inteiro -jmax número inteiro
-omnia alternancia -sim número inteiro -frequencia booleano -impressão booleano -arquivo de saída arquivo de saída
-ujtablefile arquivo de saída -outseq seqoutall
integrações -Socorro
DESCRIÇÃO
integrações é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Nucleic: Composition".
OPÇÕES
Entrada seção
-seqüência sequência
-lwin número inteiro
Valor padrão: 100
-degrau número inteiro
Deslocamento da janela sobre a sequência Valor padrão: 5
-jmin número inteiro
Valor padrão: 4
-jmax número inteiro
Valor padrão: 6
Avançado seção
-omnia alternancia
Calcule sobre um conjunto de sequências Valor padrão: N
-sim número inteiro
Calcule a complexidade linguística por comparação com uma série de simulações tendo
uma distribuição uniforme de bases
-frequencia booleano
Execute a simulação de uma sequência com base na frequência base do original
sequência Valor padrão: N
saída seção
-impressão booleano
Gere um arquivo chamado UjTable contendo os valores de Uj para cada palavra j no real
sequência (s) e em quaisquer sequências simuladas Valor padrão: N
-arquivo de saída arquivo de saída
-ujtablefile arquivo de saída
Valor padrão: complex.ujtable
-outseq seqoutall
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