Este é o comando e-PCR que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
e-PCR - Encontre locais marcados com sequência (STS) em sequências de DNA
SINOPSE
PCR eletrônico [-hV] [opções-posix] arquivo sts [rápido ...] [opções-compat]
DESCRIÇÃO
O programa substitui a explosão na localização de pares de primers no genoma que podem
produzir um produto de PCR.
OPÇÕES
As opções posix são:
-m =## Margem (padrão 50)
-w =## Tamanho da palavra (padrão 7)
-n =## Máximo de incompatibilidades permitidas (padrão 0)
-g =## Indels máximos permitidos (padrão 0)
-f =## Use ## palavras não contíguas, lento se ##> 1
-o =## Definir arquivo de saída
-t =## Defina o formato de saída:
1 - clássico, intervalo (pos1..pos2)
2 - clássico, ponto médio
3 - tabular
4 - tabular com alinhamento nos comentários (lento)
-d =## - ## Definir intervalo de tamanho padrão (padrão 100-350)
-p =+- Ativar / desativar acessos pós-processamento
-v =## Sinalizadores de verbosidade
-a =a | f Use pré-dimensionamento de alinhamentos (somente se lacunas> 0), lento
a - Sempre ou f - como reserva
-x =+- Use o mascaramento de minúsculas na extremidade 5 'dos primers (padrão -)
-u =+- Todos os primers em maiúsculas (padrão -)
opções de compatibilidade (opções de posix duplicadas) são
M=## Margem (padrão 50)
W=## Tamanho da palavra (padrão 7)
N=## Número de incompatibilidades permitidas (padrão 0)
G=## Indels máximos permitidos (padrão 0)
F=## Use ## palavras descontínuas
O=## Defina o arquivo de saída para ##
T=## Definir formato de saída (1..3)
D=## - ## Definir intervalo de tamanho padrão
P=+- Hits pós-processamento ativado / desativado
V=## Sinalizadores de verbosidade
A=a | f Use pré-dimensionamento de alinhamentos (somente se lacunas> 0), lento
a - Sempre ou f - como reserva
X=+- Use o mascaramento de minúsculas na extremidade 5 'dos primers (padrão -)
U=+- Todos os primers em maiúsculas (padrão -)
-m meio Igual a T = 2
Para obter informações sobre outras opções, basta ligar PCR eletrônico sem opções.
Use e-PCR online usando serviços onworks.net