Este é o comando fsl que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fsl - ferramentas de análise para imagens de FMRI, MRI e DTI cerebrais
DESCRIÇÃO
FSL é um kit de ferramentas abrangente para a análise de dados de imagens médicas do cérebro. Isto
fornece ferramentas para pré-processamento de dados, extração de cérebro, registro de imagens, bem como um
amplo espectro de análises estatísticas. FSL fornece uma GUI fácil de usar.
FSL requer uma série de variáveis de ambiente a serem definidas corretamente. Para alcançar isto,
por favor, fonte o script de configuração de /etc/fsl/5.0/fsl.sh. Uma maneira de fazer isso
automaticamente é adicionar uma linha contendo
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
para o arquivo .bashrc em um diretório inicial do usuário (ou um arquivo correspondente para outros shells
do que bash). Pode ser necessário criar esse arquivo primeiro.
Alternativamente, o pacote Debian instala links simbólicos para todas as ferramentas FSL em / usr / bin que
tome cuidado ao carregar a configuração apropriada automaticamente. Os nomes dos links simbólicos são
prefixado com o correspondente FSL versão para evitar conflitos de nome de arquivo e permitir
várias versões para coexistir no mesmo sistema. Por exemplo, o fatiador comando é
disponível como fsl5.0-sliceer. Por favor, note que para usar FSL ferramentas através desses links simbólicos, é
não necessário para realizar o procedimento de configuração descrito acima. No entanto, esta conveniência
recurso é específico do Debian. Scripts que empregam comandos FSL e devem ser compartilhados
com outros deve contar com nomes de comando não prefixados e a variável de ambiente FSL
configuração.
A FSL interface do usuário às vezes se refere a um FSLDIR. Em sistemas Debian, isso é
/usr/share/fsl/5.0 para FSL versão 5.0.
FSL documentação e ajuda online são fornecidas pelo fsl-5.0-doc pacote.
Perguntas sobre o uso de FSL ou teoria relacionada pode ser postada no FSL correspondência
Lista (Vejo http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
PARALELIZAÇÃO
O FSL pode ser configurado para enviar trabalhos a um Sun Gridengine (SGE) em execução. Embora não seja tudo
funcionalidade implementada em FSL suporta este tipo de paralelização, o mais exigente
ferramentas de processamento (por exemplo, POSSUM e FDT) fazem.
FSL deve ser capaz de usar SGE mesmo se a variável de ambiente SGE_ROOT não estiver definida, como em
o caso do pacote Debian do SGE. Para habilitar o processamento em lote, basta definir
FSLPARALLEL = 1
no shell onde o FSL está sendo executado. Isso pode ser ativado permanentemente em
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
ou caso a caso.
Use fsl online usando serviços onworks.net
