Este é o comando fuzzproe que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
fuzzpro - Pesquisa de padrões em sequências de proteínas
SINOPSE
fuzzpro -seqüência sequência -padronizar de cinto de segurança -arquivo de saída Denunciar
fuzzpro -Socorro
DESCRIÇÃO
fuzzpro é um programa de linha de comando da EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
Suite de software ”). Faz parte do (s) grupo (s) de comando "Proteína: Motivos".
OPÇÕES
Entrada seção
-seqüência sequência
-padronizar de cinto de segurança
São usados os códigos padrão de uma letra IUPAC para os aminoácidos. O símbolo 'x' é
usado para uma posição onde qualquer aminoácido é aceito. Ambiguidades são indicadas por
listando os aminoácidos aceitáveis para uma determinada posição, entre parênteses quadrados '[
] '. Por exemplo: [ALT] significa Ala ou Leu ou Thr. Ambiguidades também são indicadas por
listar entre um par de chaves '{}' os aminoácidos que não são aceitos
em uma determinada posição. Por exemplo: {AM} significa qualquer aminoácido, exceto Ala e Met.
Cada elemento em um padrão é separado de seu vizinho por um '-'. (Opcional em
fuzzpro). A repetição de um elemento do padrão pode ser indicada seguindo que
elemento com um valor numérico ou um intervalo numérico entre parênteses. Exemplos:
x(3) corresponde a xxx, x (2,4) corresponde a xx ou xxx ou xxxx. Quando um
padrão é restrito ao terminal N ou C de uma sequência, esse padrão
ou começa com um símbolo '<' ou, respectivamente, termina com um símbolo '>'. Um período termina
o padrão. (Opcional no fuzzpro). Por exemplo, [DE] (2) HS {P}X(2) PX (2,4) C
saída seção
-arquivo de saída Denunciar
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