Este é o comando glam2scan que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
glam2scan - encontra um motivo GLAM2 em um banco de dados
SINOPSE
glam2scan [opções] alfabeto meu_motivo.glam2 meu_seqs.fa
Um alfabeto diferente de p or n é interpretado como o nome de um arquivo alfabético.
DESCRIÇÃO
glam2scan encontra correspondências, em um banco de dados de sequência, a um motivo descoberto por glamour2. Cada
a partida recebe uma pontuação, indicando o quão bem ela se encaixa no motivo.
OPÇÕES (PREDEFINIÇÃO DEFINIÇÕES)
-h
Mostra todas as opções e suas configurações padrão.
-o
Arquivo de saída (stdout).
-n
Número de alinhamentos a relatar (25).
-2
Examine as duas vertentes - complemento para a frente e para trás.
-D
Pseudocontagem de exclusão (0.1).
-E
Pseudocontagem sem exclusão (2.0).
-I
Pseudoconta de inserção (0.02).
-J
Pseudoconta sem inserção (1.0).
-d
Arquivo de mistura de Dirichlet.
Use glam2scan online usando serviços onworks.net
