Este é o comando gmod_fasta2gff3.plp que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
$ O - Converter FASTA em GFF3 simples
SINOPSE
% $ O [opções]
LINHA DE COMANDO OPÇÕES
--fasta_dir O diretório contém arquivos fasta
(padrão: ./fasta)
--gfffilename Nome do arquivo GFF3 a ser criado
(padrão: ./out.gff)
--tipo tipo de SO para atribuir a cada recurso
(padrão: EST)
- fonte de texto para aparecer na coluna de origem
(predefinição: .)
--attributes Tag adicional = pares de valor a serem exibidos na coluna 9
--nosequence Suprime a seção ## FASTA (ou seja, não
imprimir sequências de DNA)
DESCRIÇÃO
Este script simplesmente pega uma coleção de arquivos fasta e os converte em GFF3 simples
adequado para carregar no chado.
AUTORES
Scott Cain[email protegido]>
Copyright (c) 2006
Esta biblioteca é um software livre; você pode redistribuí-lo e / ou modificá-lo sob o mesmo
termos como o próprio Perl.
Use gmod_fasta2gff3.plp online usando serviços onworks.net