Este é o comando gt-chain2dim que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online Windows ou emulador online MAC OS
PROGRAMA:
NOME
gt-chain2dim - Correspondências de pares em cadeia.
SINOPSE
gt cadeia2dim [opções] -m matchfile
DESCRIÇÃO
-m [nome do arquivo]
Especifique o arquivo contendo a opção obrigatória de correspondências (padrão: indefinido)
-global
realizar encadeamento global
· Parâmetro opcional gc muda os custos de lacuna (de acordo com o modelo L1)
· O parâmetro opcional ov significa que as sobreposições entre as correspondências são permitidas
· Parâmetro opcional significa que todas as cadeias ideais são processadas
-local
realizar encadeamento local computar cadeias locais (de acordo com o modelo L1).
· Se nenhum parâmetro for fornecido, calcule as cadeias locais com pontuação máxima.
· Se o parâmetro for fornecido, este deve ser um número positivo opcionalmente seguido pelo
caractere b ou p.
· Se apenas o número, digamos k, é dado, esta é a pontuação mínima das cadeias
saída.
· Se um número é seguido pelo caractere b, a saída de todas as cadeias com o maior k
pontuações.
· Se um número é seguido pelo caractere p, a saída de todas as cadeias com pontuações no máximo
k por cento de distância da melhor pontuação.
-wf [valor]
especificar fator de peso> 0.0 para obter a pontuação de um fragmento requer uma das opções
-local const -global gc -global ov (padrão: 1.000000)
-maxgap [valor]
especifique a largura máxima da lacuna na cadeia (padrão: 0)
- silencioso [sim | não]
não produza as cadeias, mas apenas relata seus comprimentos e pontuações (padrão: não)
-v [sim | não]
ser prolixo (padrão: não)
-Socorro
exibir ajuda e sair
-versão
exibir informações de versão e sair
RELATÓRIOS INSETOS
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