Este é o comando gt-gff3validator que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas múltiplas estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online de Windows ou emulador online de MAC OS.
PROGRAMA:
NOME
gt-gff3validator - Valida estritamente determinados arquivos GFF3.
SINOPSE
gt validador gff3 [opção ...] [GFF3_file ...]
DESCRIÇÃO
-typecheck [corda]
use uma ontologia fornecida em um arquivo OBO para validar relacionamentos pai-filho. Se não
o argumento é fornecido, o arquivo sofa.obo do diretório gtdata / obo_files é usado. Se
um argumento é fornecido, ele é usado como um nome de arquivo OBO. No caso de tal arquivo
não existe .obo é adicionado ao argumento e carregando o nome do arquivo resultante do
O diretório gtdata / obo_files foi tentado. (padrão: indefinido)
-xrfcheck [corda]
verifique os atributos Dbxref e Ontology_term para a sintaxe correta de acordo com um
arquivo de definição de abreviatura. Se nenhum argumento for fornecido, o arquivo GO.xrf_abbs do
O diretório gtdata / xrf_abbr é usado. Se um argumento é fornecido, ele é usado como um argumento específico
nome do arquivo para um arquivo de abreviatura. Caso tal arquivo não exista,
.xrf_abbr é adicionado ao argumento e carregando o nome do arquivo resultante do
O diretório gtdata / xrf_abbr foi tentado. (padrão: indefinido)
-Socorro
exibir ajuda e sair
-versão
exibir informações de versão e sair
RELATÓRIOS INSETOS
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