Este é o comando hmm-assembler.pl que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
hmm-assembler.pl - módulo SNAP hmm-assembler.pl
SINOPSE
hmm-assembler.pl [-OPÇÕES [-MAIS OPÇÕES]] [--] [PROGRAM_ARG1 ...]
OPÇÕES
A seguinte um único caractere opções e guarante que os mesmos estão aceitaram:
Com argumentos: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Booleano (sem argumentos): -r -o -x -p -t -1
As opções podem ser mescladas. -- interrompe o processamento de opções. Espaço não é necessário
entre as opções e seus argumentos.
opções:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] inclui o modelo 3'UTR, requer -a
-a [] inclui o modelo PolyA, requer -3
-5 [] inclui 5'UTR moel, requer -p
-p inclui modelo de promotor genérico, requer -5
-r incluir modelo de repetição genérico
-o incluir modelo ORF reverso
-x usar modelo de intron de duração explícita
-t inclui C.elegans trans-splicing, requer -p, -5
-Z define valores específicos de clado (verme, mosca, planta)
-1 modelo de gene único
-c
incluem modelo de doador de splice GC-AG
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