Este é o comando khmer que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
khmer - contagem de k-mer, filtragem e passagem de gráfico FTW!
khmer é uma biblioteca e kit de ferramentas para fazer análises e transformações de conjunto de dados baseadas em k-mer
SINOPSE
khmer [opções] args
por exemplo.
khmer carga para contagem -x 1e8 -k 20 leituras.ct leituras.fa.gz
USO
Esta página de manual descreve apenas o khmer script de invólucro. Para saber mais sobre o software e
como usá-lo, consulte / usr / share / doc / khmer ou então http://khmer.readthedocs.org/.
No Debian / Ubuntu, os mantenedores do pacote evitam colocar grandes coleções de scripts diretamente
no PATH do sistema. Em vez disso, um único script de wrapper é usado para iniciar o script que você
deseja usar; portanto, se as instruções do khmer disserem para executar carregar em contagem.py
...qualquer que seja... você precisa prefixar este comando com khmer. Além disso, a extensão .py
pode ser omitido, resultando em um comando do formato mostrado acima.
Se você não gosta disso, simplesmente adicione / usr / lib / khmer / bin ao seu PATH pessoal.
Use khmer online usando serviços onworks.net
