Este é o comando ltrsift que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS
PROGRAMA:
NOME
ltrsift - uma interface gráfica para pós-processamento e classificação de LTR
candidatos a retrotransposon
SINOPSE
ltsift
DESCRIÇÃO
LTRsift é uma ferramenta gráfica de desktop para pós-processamento semiautomático de predito de novo
Anotações de retrotransposões LTR, como as geradas por LTRharvest e LTRdigest.
CONFIGURAÇÃO
Os ÚLTIMOS binários (lastal e lastdb) devem estar localizados no caminho de pesquisa do sistema. Se eles
não, é possível especificar sua localização usando o ambiente “GT_LAST_PATH"
variável antes de executar LTRsift. O mesmo se aplica ao local do BLAST. Usar
`` GT_BLAST_PATH ”para especificar o caminho completo para o executável“ blastall ”.
Os arquivos de estilo (que descrevem como o diagrama linear das características candidatas se parecem) podem ser
definido por meio da variável de ambiente LTRSIFT_STYLE_FILE. Um estilo padrão sensato é construído
em LTRsift.
Use ltrsift online usando serviços onworks.net