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mapMers - Online na nuvem

Execute mapMers no provedor de hospedagem gratuita OnWorks no Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

Este é o comando mapMers que pode ser executado no provedor de hospedagem gratuita OnWorks usando uma de nossas várias estações de trabalho online gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador online do Windows ou emulador online do MAC OS

PROGRAMA:

NOME


mapMers - relata estatísticas de mapeamento de kmers para sequências

SINOPSE


mapMers {-Estatísticas|-regiões|-detalhes} -m mersize -mers mers -seq fasta

OPÇÕES


-Estatísticas relata a média, mínimo e máximo para cada sequência, junto com um log2
histograma das contagens

-regiões
reporta regiões com cobertura kmer

-detalhes
relata a contagem direta e reversa no banco de dados para cada kmer na sequência

-m mersize

-mers mers
a Meryl(1) banco de dados

-seq fasta
arquivo de sequência de entrada

Use mapMers online usando serviços onworks.net


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