mia-3dgetslice - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

mia-3dgetslice - Extraia fatias de uma imagem 3D.

SINOPSE

mia-3dgetslice -i -o [opções]

DESCRIÇÃO

mia-3dgetslice Este programa é usado para extrair fatias 2D de um conjunto de dados 3D e armazená-las
em arquivos separados. Os arquivos de saída serão numerados de acordo com seu índice de fatias.

OPÇÕES

-i --in-file = (entrada, obrigatório); Io
imagem (ns) de entrada a serem filtradas Para os tipos de arquivo suportados, consulte
PLUGINS: 3dimage / io

-o --out-file = (saída, obrigatório); Io
imagem (ns) de saída. Se número! = 1, então este é usado como um nome de base e deve
ser fornecido sem extensão, pois será baseado na opção '--type'.
Se número = 1, então este nome de arquivo exato será usado. Para arquivo compatível
tipos, consulte PLUGINS: 2dimage / io

-t --type = png
tipo de arquivo de saída para número! = 1
Suportado valores estão:( bmp, conjunto de dados, dicom, ex, jpg png, cru,
tif, vista )

-s --start = 0
número inicial da fatia; número inicial da fatia

-n --number = 1
número de fatias (todas = 0) número de fatias (todas = 0)

--ndigits = 4
número mínimo de dígitos dos números do nome do arquivo (se n! = 1) número mínimo
de dígitos dos números do nome do arquivo (se n! = 1)

-d --dir = xy
direção da fatia (xy = axial, xz = coronal, yz = sagital)
xz - obter fatia xz (coronal)
yz - obter fatia yz (saggital)
xy - obter corte xy (axial)

Ajuda & Info
-V --verbose = aviso
detalhamento de saída, mensagens de impressão de determinado nível e prioridades mais altas.
As prioridades com suporte começando no nível mais baixo são:
info - Mensagens de baixo nível
traçar - Rastreamento de chamada de função
falhar - Reportar falhas de teste
aviso - Avisos
erro - Reportar erros
depurar - Saída de depuração
mensagem - Mensagens normais
fatal - Reportar apenas erros fatais

--direito autoral
imprimir informações de direitos autorais

-h --ajuda
imprima esta ajuda

-? --uso
imprimir uma pequena ajuda

--versão
imprima o número da versão e saia

Tratamento
--threads = -1
Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento, este número deve ser menor
ou igual ao número de núcleos de processador lógico na máquina. (-1:
estimativa automática). Número máximo de threads a serem usados ​​para processamento,
o número deve ser menor ou igual ao número de núcleos de processador lógico em
a máquina. (-1: estimativa automática).

PLUGINS: 2dimage / io

bmp Suporte para entrada / saída de imagem BMP 2D

Extensões de arquivo reconhecidas: .BMP, .bmp

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal

conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno

Extensões de arquivo reconhecidas:. @

dicom Io de imagem 2D para DICOM

Extensões de arquivo reconhecidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos suportados:
16 bits com sinal, 16 bits sem sinal

exr um plugin 2dimage io para imagens OpenEXR

Extensões de arquivo reconhecidas: .EXR, .exr

Tipos de elementos suportados:
32 bits sem sinal, ponto flutuante de 32 bits

jpg um plugin 2dimage io para imagens jpeg em escala de cinza

Extensões de arquivo reconhecidas: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipos de elementos suportados:
8 bits sem sinal

png um plugin 2dimage io para imagens png

Extensões de arquivo reconhecidas: .PNG, .png

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal

cru Suporte para saída de imagem 2D RAW

Extensões de arquivo reconhecidas: .RAW, .raw

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

tif Suporte para entrada / saída de imagem TIFF 2D

Extensões de arquivo reconhecidas: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipos de elementos suportados:
dados binários, 8 bits sem sinal, 16 bits sem sinal, 32 bits sem sinal

vista um plugin 2dimage io para imagens vista

Extensões de arquivo reconhecidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

PLUGINS: 3dimage / io

analisar Analisar imagem 7.5

Extensões de arquivo reconhecidas: .HDR, .hdr

Tipos de elementos suportados:
8 bits não assinados, 16 bits assinados, 32 bits assinados, ponto flutuante 32 bits,
ponto flutuante de 64 bits

conjunto de dados IO virtual de e para o pool de dados interno

Extensões de arquivo reconhecidas:. @

dicom Série de imagens Dicom como 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos suportados:
16 bits com sinal, 16 bits sem sinal

hdf5 IO de imagem 5D HDF3

Extensões de arquivo reconhecidas: .H5, .h5

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, 64 bits assinados, 64 bits não assinados, flutuante
ponto de 32 bits, ponto flutuante de 64 bits

ínria Imagem INRIA

Extensões de arquivo reconhecidas: .INR, .inr

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits

mhd MetaIO 3D IO de imagem usando a implementação VTK (experimental).

Extensões de arquivo reconhecidas: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits

bacana NIFTI-1 imagem 3D IO

Extensões de arquivo reconhecidas: .NII, .nii

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, 64 bits assinados, 64 bits não assinados, ponto flutuante 32
bit, ponto flutuante 64 bits

vff Formato raster VFF Sun

Extensões de arquivo reconhecidas: .VFF, .vff

Tipos de elementos suportados:
8 bits sem sinal, 16 bits com sinal

vista Visualização 3D

Extensões de arquivo reconhecidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

vti Entrada e saída VTK-XML de imagem 3D (experimental).

Extensões de arquivo reconhecidas: .VTI, .vti

Tipos de elementos suportados:
8 bits assinados, 8 bits não assinados, 16 bits assinados, 16 bits não assinados, 32 assinados
bit, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64 bits

vtk Entrada e saída de legado de imagem 3D VTK (experimental).

Extensões de arquivo reconhecidas: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipos de elementos suportados:
dados binários, assinados 8 bits, não assinados 8 bits, assinados 16 bits, não assinados 16 bits,
32 bits assinados, 32 bits não assinados, ponto flutuante 32 bits, ponto flutuante 64
bocado

EXEMPLO

Armazene 5 cortes coronais começando na fatia 120 coronalXXXX.png de image.v.

mia-3dgetslice -i imagem.v -o coronal -t png -n 5 -s 120

AUTOR (es)

Gert Wollny

DIREITOS AUTORAIS

Este software é protegido por Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemanha e Madrid, Espanha. Vêm
com ABSOLUTAMENTE NENHUMA GARANTIA e você pode redistribuí-lo sob os termos do GNU
LICENÇA PÚBLICA GERAL Versão 3 (ou posterior). Para obter mais informações, execute o programa com o
opção '--copyright'.

Use mia-3dgetslice online usando serviços onworks.net