minctoecat - Online na nuvem

PROGRAMA:

NOME

minctecat - converte um arquivo de formato minc em um arquivo de formato Ecat7

SINOPSE

minctoecat [ ]

minctoecat [-ajuda]

DESCRIÇÃO

minctoecat irá converter uma imagem 2D, volumes 3D ou volumes dinâmicos 4D escritos em minc
formato de arquivo para um arquivo 2D, 3D ou 4D Ecat7. Considerando que o formato Ecat7 foi projetado para
Volume PET emitido por scanners Ecat (CTI / SIEMENS - Knoxville, TN, EUA) lê qualquer minc
tipo de volume (PET estático, PET dinâmico, aMRI, fMRI, rótulos) entregue nativamente por qualquer
marca de tomógrafo e transformá-lo em um arquivo Ecat7 viável em termos de número de dimensões,
tamanho da dimensão, etapa da dimensão, orientação, posição espacial, valores de voxel e voxel
unidade. Além disso, ele tenta o melhor que pode preencher os campos opcionais do cabeçalho Ecat7 de
as variáveis ​​e atributos minc disponíveis. Por padrão, ele extrai esses
informações de variáveis ​​minc comuns, a saber: variável_do_paciente, variável_de_estudo,
variável_de_ aquisição. No caso de volumes originalmente entregues por scanners Ecat PET,
então, outras variáveis ​​geralmente estão disponíveis no cabeçalho minc:
ecat_acquisition_variable, ecat_main e ecat_sub-header_variable. Lá, para um tal minc
volume, a conversão produz um volume Ecat7 quase idêntico ao nativo original
volume em termos de campos de cabeçalho. O usuário pode alterar este comportamento usando a lista de ignorados
opções (consulte a seção de opções).

OPÇÕES

Observe que as opções podem ser especificadas de forma abreviada (desde que sejam exclusivas) e
pode ser fornecido em qualquer lugar na linha de comando.

Command específico opções

-ignore_paciente_variável: Ignore as informações da variável de paciente minc (paciente MI).

-ignore_study_variable: Ignore as informações da variável de estudo minc (MIstudy).

-ignore_acquisition_variable: Ignore as informações da variável de aquisição minc
(MI aquisição).

-ignore_ecat_accquisition_variável: Ignorar informações da aquisição minc ecat
variável (MIecat_acquisition).

-ignore_ecat_main_variável: Ignore as informações da variável minc ecat-mainheader
(MIecat-principal).

-ignore_ecat_subheader_variável: Ignore as informações da variável minc ecat-subheader
(Subcabeçalho MIecat).

-no_decay_corr_fctr: não regenere os fatores de correção de decaimento empregados como parte como
a reconstrução do volume PET original. Os fatores de correção são um campo no
subcabeçalhos ecat que podem ser usados ​​por programas de processamento. Por padrão, se o volume for um
Volume PET, esses fatores são regenerados. Esta opção não tem interesse no caso de não
Dados PET.

-rótulo: Trata o voxel como valores inteiros em vez de valores de ponto flutuante. Neste caso, o
os fatores de escala e os fatores de calibração são ambos configurados para a unidade. Esta opção é
particularmente útil quando os arquivos minc de entrada são um volume de rótulos.

Geral opções

-ajuda: Imprime o resumo das opções da linha de comando e aborta

-versão: Imprima a versão do programa e aborte

CONHECIDO INSETOS

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