Este é o aplicativo Linux denominado ADOMA, cuja versão mais recente pode ser baixada como adoma-1.0.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado ADOMA com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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ADOMA
DESCRIÇÃO
ADOMA significa: Alternative Display Of Multiple Alignment. O ADOMA pode criar quatro exibições diferentes de um alinhamento de sequência múltipla: um alinhamento ClustalW em formato HTML, um alinhamento ClustalW simplificado em formato HTML e / ou txt e um alinhamento ClustalW colorido em formato HTML. Para exemplos desses arquivos de saída, verifique as imagens. O ADOMA usa o ClustalW para criar o alinhamento múltiplo de sequências de DNA ou proteínas e os exibe um pouco diferente do que a saída normal do ClustalW. ADOMA é um programa de linha de comando que pode ser facilmente usado em pipelines.
Para obter mais informações, verifique o README.md na seção Arquivos.
Como citar ADOMA:
Zaal, D. e Nota, B. (2016), ADOMA: A Command Line Tool to Modify ClustalW Multiple Alignment Output. Mol. Inf. 35: 42–44. doi: 10.1002 / minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Shell Unix, Python
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/adoma/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.