Este é o aplicativo Linux denominado AMBIENT para execução em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como ambiente-1.3.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado AMBIENT para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
AMBIENT para rodar em Linux online
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DESCRIÇÃO
IMPORTANTE: Desde a publicação do método AMBIENT no BMC Sys Bio, várias atualizações foram feitas. Se você deseja usar a versão usada no paper é a v0.6.3, porém recomendo usar a versão mais recente que funciona da mesma forma, mas com opções adicionais e tem melhorias de estabilidade e desempenho. Obrigado pelo seu interesse!AMBIENT (Módulos Ativos para Redes Bipartidas) é um módulo Python que usa recozimento simulado para encontrar áreas de uma rede metabólica (módulos) que possuem alguma característica consistente. AMBIENT não requer vias predefinidas e fornece previsões altamente específicas de áreas afetadas do metabolismo.
Por exemplo, pontuações para reações com base em dados de transcrição de seus genes de codificação anotados podem ser usadas na rede e módulos de mudanças de expressão coordenadas podem ser encontrados. Isso fornece uma alternativa para análises de enriquecimento de conjunto de caminho / gene que é simultaneamente mais flexível e mais específico.
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
Python
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/ambient-bio/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
