Este é o aplicativo Linux denominado BioEvent, cuja versão mais recente pode ser baixada como bioevent-v0.01-all.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado BioEvent com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
BioEvento
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DESCRIÇÃO
Este é um projeto baseado em Java para extração de eventos complexos de resolução de texto e co-referência. Atualmente, o código pode ler o formato de tarefa compartilhada BioNLP (http://2011.bionlp-st.org/) e processamento de linguagem natural i2b2 para formato de tarefa compartilhada de dados clínicos (https://www.i2b2.org/NLP/DataSets/Main.php) A extração de eventos inclui a localização de eventos e os parâmetros de um evento em um texto.
O método é baseado em SVM, mas outros algoritmos de ML podem ser adotados. Os detalhes do método são explicados no seguinte artigo:
Ehsan Emadzadeh, Azadeh Nikfarjam e Graciela Gonzalez. 2011. Aprendizagem em camada dupla para extração de eventos biológicos de texto. Em Proceedings of the BioNLP 2011 Workshop Companion Volume for Shared Task, Portland, Oregon, junho. Association for Computational Linguistic
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Perl, Java
Ambiente de Banco de Dados
JDBC, MySQL
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/bioevent/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
