Este é o aplicativo Linux denominado CaptureProbe, cuja versão mais recente pode ser baixada como Runningexample.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado CaptureProbe com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
CaptureProbe
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DESCRIÇÃO
Aqui, desenvolvemos CaptureProbe, uma ferramenta Java gráfica amigável para projetar sondas de captura para aplicativos Capture Hi-C. CaptureProbe é fácil de usar, só precisa de arquivos de entrada simples e fornece parâmetros abundantes para o projeto de sondas. CaptureProbe pode projetar sondas especificamente para locais genômicos e regiões genômicas de interesse. Comparações com softwares existentes (HiCapTools e GOPHER) indicaram que CaptureProbe tem uma boa taxa de sucesso de design e melhor especificidade de sonda.
Citação: MA YF, ADEOLA AC, SUN YB, et al. 2020. CaptureProbe: uma ferramenta java para projetar sondas para aplicativos de captura Hi-C. Zool Res [J], 41: 94-96.
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/captureprobe/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.