Este é o aplicativo Linux denominado CStone, cuja versão mais recente pode ser baixada como cstone.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado CStone com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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CSstone
DESCRIÇÃO
CStone é um montador de novo para dados de RNA-Seq que usa de Bruijn como gráficos e anota cada contig produzido com um dos três níveis de classificação de gráfico, indicando se pode ou não ser garantido como não quimérico. Os níveis de classificação dependem da complexidade da família de genes da qual as leituras são derivadas. Como um subproduto, isso também fornece uma visão sobre a composição estrutural das famílias de genes subjacentes que foram sequenciadas. Mais detalhes estarão disponíveis em breve em nosso jornal: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
Funcionalidades
- Montagem de novo de dados de RNA-Seq.
- Identificação de contigs não quiméricos.
- Compatibilidade entre plataformas.
- Jar executável disponível.
- Nenhum pacote externo necessário.
- Código fácil de seguir e incorporado a outras ferramentas.
- Informações sobre a complexidade das famílias de genes subjacentes.
- de Bruijn como uma abordagem (mais branda).
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/cstone/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
