Este é o aplicativo Linux chamado FamSeq, cuja versão mais recente pode ser baixada como FamSeq1.0.2.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado FamSeq com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
FamSeq
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DESCRIÇÃO
Ainda é um desafio chamar de variantes raras. Em estudos de sequenciamento com base na família, as informações de todos os membros da família devem ser utilizadas para identificar com mais precisão novas mutações na linha germinativa. FamSeq atende a esse propósito, fornecendo a probabilidade de um indivíduo carregar uma variante, dadas as medidas brutas de toda a sua família. FamSeq acomoda mutações de novo e pode realizar chamadas variantes no cromossomo X.
Para acomodar variações na complexidade dos dados, o FamSeq consiste em três implementações distintas do modelo genético de Mendel: o algoritmo de rede Bayesiana, o algoritmo de Elston-Stewart e o algoritmo de Monte Carlo da cadeia de Markov. Para tornar o software eficiente e aplicável a famílias grandes, paralelizamos o algoritmo de rede bayesiana que lida com pedigrees com loops de endogamia sem perder a precisão do cálculo em uma unidade de processamento gráfico NVIDIA®.
Público
Ciência / Pesquisa
Linguagem de Programação
C + +
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/famseq/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
