Este é o aplicativo Linux denominado FastQC, cuja versão mais recente pode ser baixada como v0.12.1sourcecode.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado FastQC com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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FastQC
DESCRIÇÃO
FastQC é uma ferramenta de análise de controle de qualidade projetada para detectar possíveis problemas em conjuntos de dados de sequenciamento de alto rendimento. Seu objetivo é fornecer uma maneira simples de verificar a qualidade dos dados de sequência bruta provenientes de pipelines de sequenciamento de alto rendimento. Ele faz isso executando um conjunto modular de análises em um ou mais arquivos de sequência bruta no formato fastq ou bam. Em seguida, ele produz um relatório resumindo os resultados e destacando quaisquer áreas em que a biblioteca possa parecer incomum. Isso deve direcioná-lo para onde seus dados podem ter problemas e permitir que você tome as medidas necessárias para corrigi-lo antes de fazer qualquer análise adicional.
O FastQC não está vinculado a nenhum tipo específico de técnica de sequenciamento, portanto, pode ser usado para examinar bibliotecas de vários tipos de experimentos (sequenciamento genômico, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq etc, etc.).
Recursos
- Importa dados de arquivos BAM, SAM ou FastQ
- Oferece uma visão geral rápida que destaca possíveis áreas problemáticas
- Gráficos e tabelas de resumo para avaliação rápida dos dados
- Exportar resultados para HTML
- Pode ser usado offline
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
