Este é o aplicativo Linux chamado Grinder para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como Grinder-0.5.4.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Grinder para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
Grinder para rodar em Linux online
Ad
DESCRIÇÃO
O Grinder é uma ferramenta de bioinformática de código aberto versátil para criar espingarda omic simulada e bibliotecas de sequência de amplicon para todas as plataformas de sequenciamento principais.Funcionalidades
- espingarda ou amplicon (por exemplo, 16S rRNA) ler bibliotecas
- suporte omics para gerar conjuntos de dados genômicos, transcriptômicos, proteômicos, metagenômicos, metatranscriptômicos ou metaproteômicos
- distribuição de comprimento de leitura arbitrária e número de leituras
- simulação de PCR e erros de sequenciamento (quimeras, mutações pontuais, homopolímeros)
- suporte para conjuntos de dados emparelhados (pares de pares)
- configurações específicas de abundância ou abundância fornecida manualmente para cada genoma, gene ou proteína
- criação de conjuntos de dados com uma dada riqueza (diversidade alfa)
- conjuntos de dados relacionados podem compartilhar um número variável de genomas (diversidade beta)
- modelagem da tendência criada pela variação do comprimento do genoma ou número de cópias do gene
- mecanismo de perfil para armazenar opções preferidas
- disponível para biólogos ou usuários avançados por meio de várias interfaces: GUI, CLI e API
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal
Linguagem de Programação
Perl
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/biogrinder/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
