Este é o aplicativo Linux chamado iPiG para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como ipig_r5.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado iPiG para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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iPiG para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
iPiG visa a integração de combinações de espectro de peptídeos (PSMs) de espectrometria de massa (MS)identificações de peptídeos em visualizações genômicas fornecidas pelo navegador do genoma, como o navegador do genoma UCSC (http://genome.ucsc.edu/).
O iPiG pega PSMs do formato padrão MS mzIdentML (* .mzid) ou em formato de texto e fornece resultados em formatos de rastreamento de genoma (arquivos BED e GFF3), que podem ser facilmente importados para navegadores de genoma.
Para obter mais detalhes sobre o iPiG e sua funcionalidade, consulte
"iPiG: Integrating Peptide Spectrum Matches Into Genome Browser Visualizations"
Mathias Kuhring e Bernhard Y. Renard
(http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0050246)
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Java Swing, console / terminal
Linguagem de Programação
Java
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/ipig/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
