Este é o aplicativo Linux chamado JSiteDescriptor cuja versão mais recente pode ser baixada como binários.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado JSiteDescriptor com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
JSiteDescriptor
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DESCRIÇÃO
Um conjunto de programas java que extrai informações de coordenadas e químicas de arquivos PDB.
As regiões do local de ligação são extraídas usando um esquema baseado em grade.
Para o sítio de ligação, o descritor espaço-químico é gerado com base no algoritmo PocketMatch do Dr. Kalidas (autor deste projeto também).
Recursos
- Geração de descritor de vetor baseado em PocketMatch para um local de ligação
- Executando em modo de arquivo PDB único ou modo em lote
- Especificação do local como vizinhança do ligante - (código do ligante, nome e ID da cadeia)
- Especificação do local como vizinhança do subconjunto do PDB usando EXPRESSÕES REGULARES
- Especificação de vários intervalos de átomos que revestem um local de ligação
- O arquivo de processamento do modo em lote captura os parâmetros de entrada por meio do arquivo XML + em conformidade com a especificação XSD
- Maior configurabilidade - seleção de grupo de resíduos, raio e categorias para sites
- Tecnologia Java Swing para GUI
- Arquitetura de software simples e extensível para desenvolvimento futuro
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Java swing
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/jsitedescriptor/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
