Este é o aplicativo Linux chamado MarDRe, cuja versão mais recente pode ser baixada como MarDRe-v1.4.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MarDRe com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
MarDRe
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DESCRIÇÃO
MarDRe é uma ferramenta paralela baseada em MapReduce de novo para remover leituras de DNA duplicadas e quase duplicadas por meio do agrupamento de sequências de extremidade única e emparelhadas de conjuntos de dados FASTQ / FASTA. Esta ferramenta permite que a bioinformática evite a análise de leituras desnecessárias, reduzindo o tempo de procedimentos subsequentes com o conjunto de dados.
MarDRe é a contraparte de Big Data do ParDRe (link acima), que emprega tecnologias HPC (ou seja, MPI híbrido / multithreading) para reduzir o tempo de execução em sistemas com vários núcleos. Em vez disso, o MarDRe aproveita o modelo de programação MapReduce para melhorar significativamente o desempenho do ParDRe em sistemas distribuídos, especialmente em infraestruturas baseadas em nuvem. Escrito em Java puro para maximizar a compatibilidade de plataforma cruzada, MarDRe é construído sobre o projeto de código aberto Apache Hadoop, a estrutura de computação distribuída mais popular para processamento de Big Data.
Público
Tecnologia da Informação, Indústria de Saúde, Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal, linha de comando
Linguagem de Programação
Java
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/mardre/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.