Este é o aplicativo Linux denominado MaxBin2, cuja versão mais recente pode ser baixada como MaxBin-2.2.7.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MaxBin2 com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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MaxBin2
DESCRIÇÃO
MaxBin2 é a próxima geração de MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/) que suporta várias amostras ao mesmo tempo. MaxBin é um software para binning sequências metagenômicas montadas com base em um algoritmo de maximização de expectativa. Os usuários podem entender os bins subjacentes (genomas) dos micróbios em seus metagenomas, simplesmente fornecendo sequências metagenômicas montadas e as informações de cobertura de leituras ou leituras de sequenciamento. Para conveniência dos usuários, o MaxBin relatará estatísticas relacionadas ao genoma, incluindo integridade estimada, conteúdo de GC e tamanho do genoma na página de resumo do binning. Os usuários podem usar o MEGAN ou software semelhante em caixas MaxBin para descobrir a taxonomia de cada caixa depois que o processo de binning for concluído.Mais informações podem ser encontradas no site oficial da MaxBin: http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
Recursos
- Metagenômica Binning
Linguagem de Programação
C + +
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/maxbin2/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.