Este é o aplicativo Linux denominado MDcons (consenso da Molecular Dynamics) para execução no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como mdcons-src-2.0.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MDcons (consenso da Molecular Dynamics) para ser executado no Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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MDcons (consenso da Molecular Dynamics) para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
MDcons é uma ferramenta para analisar contatos conservados durante simulações de Dinâmica Molecular (MD) de complexos baseados em Proteína, Rna, Dna e Ligante. A entrada é uma trajetória da Dinâmica Molecular ou um conjunto de instantâneos. A entrada também pode ser um único instantâneo. As saídas são (1) mapa dos contatos mais / menos freqüentemente conservados durante o MD (2) uma lista dos contatos mais / menos freqüentemente conservados durante o MD.Funcionalidades
- MDcons é executado em mais de 2000 instantâneos de MD em menos de 2 minutos
- MDcons lida com complexos de proteínas, RNA e DNA
- MDcons lida com trajetórias / instantâneos com ou sem identificador de cadeia
- MDcons é compatível com GROMACS
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Console / Terminal, linha de comando
Linguagem de Programação
Fortran, Python
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/mdcons/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.