Este é o aplicativo Linux chamado MendelChecker cuja última versão pode ser baixada como MendelChecker_v2.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MendelChecker com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
MendelChecker
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DESCRIÇÃO
MendelChecker é uma medida baseada na probabilidade da segregação Mendeliana de Polimorfismos de Nucleotídeo Único (SNPs) em linhagens nucleares. Desenvolvemos este método como uma medida de controle de qualidade para a descoberta de novas variantes a partir de dados de sequenciamento de última geração barulhentos em pedigrees, como o sequenciamento de DNA associado ao local de restrição (RAD-seq) em organismos não-modelo. Este método implementa a comparação da transmissão heterogamética vs. homogamética, ou seja, ligação sexual vs. segregação autossômica.
Funcionalidades
- Medir a probabilidade de transmissão mendeliana em pedigrees
- Autossomo vs. atribuição de cromossomos sexuais
- Lê a saída padrão do GATK
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.