Este é o aplicativo Linux chamado MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, cuja versão mais recente pode ser baixada como meta_phat.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado MetaPhat -meta-pheno-association-tracker com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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MetaPhat -meta-feno-associação-rastreador
DESCRIÇÃO
MetaPhat é uma ferramenta ativa e de código aberto (licença MIT) para detectar variantes com associações multivariadas usando estatísticas resumidas de estudos GWAS univariados. O aplicativo também executa a decomposição, encontrando subconjuntos BIC ideais e características de driver de valor P para as variantes de lead multivariadas. Os resultados das variantes são rastreados e agrupados para auxiliar na dissecção das relações fenótipos-genótipos.Consulte nossa página inicial do wiki para obter instruções de instalação, formatos de dados GWAS necessários e exemplos de entrada com o comando de teste - https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Home/
Dados globais de lipídios (GLGC, Willer 2013) / exemplo de alcatrão de origem - https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Se você tiver problemas ou tiver solicitações de recursos depois de tentar o exemplo e ler o tutorial, envie um e-mail para: [email protegido]
Copyright <2019> [email protegido], [email protegido]
Funcionalidades
- análise multivariada de características de todo o genoma
- Seleção de subconjunto de características ideal com base em valor p e BIC
- traços de traços de decomposição
- SNP principal e arquivo de resumo de características de driver
- cluster lanceiro de classificação de traço snp-snp
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
