Este é o aplicativo Linux denominado miniABS, cuja versão mais recente pode ser baixada como miniABS_0.1.0.tar.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado miniABS with OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
miniABS
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DESCRIÇÃO
miniABS (mini Absolute Breast Cancer Subtyper) é um classificador de subtipo absoluto de amostra única para câncer de mama usando o modelo Random Forest de relações de expressão gênica em pares (PGER) entre 11 genes funcionais. Com uma seleção sistemática de genes e etapa de redução, nosso objetivo foi minimizar o tamanho do conjunto de genes sem perder a interpretabilidade funcional do classificador. Validamos o desempenho do modelo usando uma coorte grande e heterogênea que consiste em vários conjuntos de dados públicos em quatro plataformas diferentes. Prevemos que a alta precisão e reprodutibilidade do miniABS pode fornecer um SSP a um baixo custo, bem como fornecer uma plataforma para comparação cruzada entre conjuntos de dados de expressão gênica gerados com diferentes plataformas técnicas.Recursos
- um classificador de subtipo absoluto de amostra única de câncer de mama com 11 genes funcionais
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/miniabs/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
