Este é o aplicativo Linux chamado PINCIS, cuja versão mais recente pode ser baixada como PINCIS_v12.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado PINCIS com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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PINCIS
DESCRIÇÃO
PINCIS.pl (PIcs N-/C-terminal Inferred Substrates script perl) é uma pequena ferramenta de linha de comando para designar e analisar dados PICS (Schilling et al., Nat. Protocols, 2011) para obter o site principal e não principal especificidade das proteases. Assim, o script filtra listas de peptídeos para peptídeos de biblioteca (gerados pela protease de digestão no fluxo de trabalho de proteômica em vez da protease de interesse) e imprime listas de extensões de janela de clivagem N- e C-terminais inferidas que podem ser usadas simultaneamente para gerar visualizações de especificidade de clivagem como o iceLogo (https://iomics.ugent.be/icelogoserver/create).
Recursos
- Análise de dados PICS
- Determinação da janela de clivagem
Público
Outro público
Linguagem de Programação
Perl
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/pincis/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
