Este é o aplicativo Linux chamado pipasic, cuja versão mais recente pode ser baixada como README.txt. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado pipasic com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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pipasico
DESCRIÇÃO
A análise metaproteômica permite estudar a interação de organismos ou grupos funcionais e tem se tornado cada vez mais popular também para fins diagnósticos. No entanto, surgem dificuldades devido à alta similaridade de sequência entre organismos relacionados. Além disso, o estado de conservação das proteínas entre as espécies pode ser correlacionado com seu nível de expressão, o que pode levar a um viés significativo nos resultados e na interpretação. Esses desafios são semelhantes, mas não idênticos, aos desafios que surgem na análise de amostras metagenômicas e requerem soluções específicas.
pipasic (correção de semelhança de abundância de proteoma ponderada por intensidade de peptídeo) é uma ferramenta que corrige resultados de identificação e quantificação com base em contagem espectral usando estimativa de similaridade de peptídeo e ponderação de nível de expressão dentro de uma estrutura de laço não negativo. pipasic tem vantagens distintas sobre abordagens apenas em relação a peptídeos únicos ou agregação de resultados para o ancestral comum mais baixo.
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Python
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/pipasic/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
