Este é o aplicativo Linux chamado PPSeq: Parallel NGS Analysis para rodar no Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado PPSeq: Parallel NGS Analysis para executar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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PPSeq: Análise NGS paralela para executar no Linux online
DESCRIÇÃO
A tecnologia de sequenciamento de última geração (NGS) de alto rendimento emergiu rapidamente como uma ferramenta poderosa em muitos aspectos da pesquisa biomédica. No entanto, junto com seu rápido desenvolvimento, a magnitude dos dados e a complexidade da análise do NGS excedem em muito a capacidade e a capacidade das instalações de computação de pequena escala tradicionais, como algoritmos de multithreading em estações de trabalho autônomas. Para resolver esse problema, apresentamos aqui uma solução usando o fornecimento cada vez maior de poder de processamento por sistemas de processamento paralelo massivo (MPP).Funcionalidades
- ppalgn - alinhando leituras de sequenciamento para sequências de referência longas
- ppbwt - construção de um índice FM a partir de um conjunto de sequências de DNA
Público
Educação, Engenharia, Indústria de Saúde, Tecnologia da Informação, Organizações sem Fins Lucrativos, Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
C + +
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/ppseq/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
