Este é o aplicativo Linux chamado qure, cuja versão mais recente pode ser baixada como QuRe_v0.99971.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado qure com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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pergunta
DESCRIÇÃO
QuRe é um programa para reconstrução de quasispécies virais, desenvolvido especificamente para analisar dados NGS de leitura longa (> 100 bp). O software realiza alinhamentos de fragmentos de sequência contra um genoma de referência, encontra uma divisão ideal do genoma em janelas deslizantes com base na cobertura e diversidade e tenta reconstruir todas as sequências individuais das quase-espécies virais - junto com sua prevalência - usando uma heurística algoritmo, que corresponde às distribuições multinomiais de variantes virais distintas que se sobrepõem na divisão do genoma. QuRe vem com um método de correção de erro de Poisson embutido e um agrupamento probabilístico pós-reconstrução, ambos parametrizados em determinadas taxas de erro em regiões homopoliméricas e não homopoliméricas.Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/qure/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.