Este é o aplicativo Linux denominado Taxoblast para rodar em Linux online, cuja versão mais recente pode ser baixada como Taxoblast1.21beta.jar. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Taxoblast para rodar em Linux online com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie o emulador OnWorks Linux online ou Windows online ou emulador MACOS online a partir deste site.
- 5. No sistema operacional OnWorks Linux que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo, instale-o e execute-o.
SCREENSHOTS
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Taxoblast para rodar em Linux online
DESCRIÇÃO
As sequências genômicas brutas são freqüentemente contaminadas com sequências de outros organismos. Sua identificação é essencial para a interpretação dos dados genômicos. Neste contexto, é essencial distinguir entre transferência horizontal de genes e contaminação. O contexto genômico das sequências pode ajudar a distinguir os dois cenários. Taxoblast divide scaffolds genômicos em sub-sequências de comprimento definido e para cada um deles determina o táxon relacionado mais próximo. Em seguida, ele resume essas informações para todo o andaime, levando em consideração a ontologia taxonômica. Os andaimes que correspondem exclusivamente aos contaminantes potenciais podem ser removidos com segurança, enquanto as sequências que correspondem aos contaminantes parcialmente e parcialmente ao organismo alvo podem constituir transferências horizontais ou artefatos de montagem e precisam ser examinados manualmente.Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Java swing
Linguagem de Programação
Java
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/taxoblast/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
