Este é o aplicativo do Windows chamado Molecular Dynamics Studio, cuja versão mais recente pode ser baixada como WindowsRelease.zip. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuita OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado Molecular Dynamics Studio com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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Estúdio de Dinâmica Molecular
DESCRIÇÃO
Esta é uma coleção de modificações de software criadas para integrar NanoEngineer-1, PACKMOL e MSI2LMP com o objetivo de criar facilmente células de dinâmica molecular. O NanoEngineer-1 é um software CAD molecular desenvolvido pela Nanorex e fornece ao usuário uma maneira fácil de criar moléculas, enquanto as modificações do software permitem que o usuário digite átomos usando vários campos de força. O PACKMOL pode gerar uma coleção aleatória de moléculas usando os modelos de moléculas do NanoEngineer-1, fornecendo assim a célula MD inicial. As modificações no PACKMOL permitem que os dados do tipo de átomo sejam passados para o software MSI2LMP. MSI2LMP cria um arquivo de entrada LAMMPS baseado em campos de força classe I ou classe II. MSI2LMP foi modificado para usar dados de campo de força codificados numericamente gerados pelo NanoEngineer-1. O formato de arquivo MMP foi estendido e integrado em todos os três aplicativos de software.http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Funcionalidades
- Capacidade de CAD molecular via NanoEngineer-1
- Digite átomos manualmente com base no campo de força atômica CFF91
- Crie modelos de moléculas usando NanoEngineer-1
- Gerar uma célula MD usando PACKMOL e modelos de moléculas múltiplas
- Gerar um arquivo de entrada de geometria LAMMPS usando MSI2LMP
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
OpenGL, Qt
Linguagem de Programação
Fortran, Python, C ++, C
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
