Este é o aplicativo do Windows chamado selectseq cuja versão mais recente pode ser baixada como selectseq_old_1.3.6. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado selectseq com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
selecioneseq
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DESCRIÇÃO
Um utilitário de linha de comando para manipular sequências biológicas de um arquivo FASTA ou FASTQ. Ele pode, dada uma lista de identificadores, obter apenas um subconjunto das sequências (ou seu complemento, ou seja, sequências que NÃO estão na lista). Também pode obter apenas o número de sequência N. Arquivos de sequências compactadas são suportados se legíveis por zcat.
Recursos
- coletar apenas algumas sequências de um arquivo FASTA ou FASTQ grande
- obter o número de sequência N apenas, independentemente do ID
- modo de complemento: retorna todas as sequências que NÃO estão na lista de IDs
- modo de "correspondência": escolha qual parte (entre | caracteres) do ID deve corresponder
- nomes de sequência fornecidos um por linha em um arquivo de texto (primeira palavra na linha usada, ou o que quer que seja fornecido com a opção -k)
- os símbolos> e @ são ignorados se estiverem presentes no início dos IDs na lista (útil se usar identificadores FASTA ou FASTQ)
- se apenas uma sequência for necessária, seu ID pode ser fornecido diretamente para a opção -l (sem necessidade de um arquivo)
- adicione um sufixo aos IDs antes de pesquisar (útil quando os IDs vêm de proteínas que têm _1 no ID, mas os genes não)
- arquivos de banco de dados de sequência compactada (-s) são suportados
- modo silencioso, exibe apenas avisos e erros importantes
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Linha de comando
Linguagem de Programação
Perl
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/selectseq/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado online da maneira mais fácil a partir de um de nossos Sistemas Operativos gratuitos.
