Aceasta este comanda cmtk-dwi_mask_bad_slices care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
dwi_mask_bad_slices - Găsiți felii proaste într-un set de imagini ponderate prin difuzie.
REZUMAT
dwi_mask_bad_slices DiffusionImagePaths
DESCRIERE
Acest instrument citește un set de imagini MR ponderate cu difuzie 3D și găsește felii proaste. O felie proastă
într-o imagine de difuziune este detectată ca una a cărei intensitate medie este în afara unui specificat
interval în jurul valorii medii a tuturor secțiunilor corespunzătoare din restul
imagini de difuzie.
OPŢIUNI
Caritate Setul de instrumente Opţiuni (aceste sunt comun by toate CMTK instrumente)
--Ajutor
Scrieți lista cu opțiunile de bază ale liniei de comandă la ieșirea standard.
--ajută-toți
Scrieți lista completă a opțiunilor de linie de comandă de bază și avansate la ieșirea standard.
--wiki
Scrieți lista de opțiuni de linie de comandă la ieșirea standard în marcajul MediaWiki.
--om
Scrieți sursa paginii de manual în marcajul „nroff” la ieșirea standard.
--versiune
Scrieți versiunea setului de instrumente în ieșirea standard.
--ecou
Scrieți linia de comandă curentă la ieșirea standard.
--nivel-verbos
Setați nivelul de verbozitate.
--verbos, -v
Creșteți nivelul de verbozitate cu 1 (învechit; acceptat pentru compatibilitate cu versiunea anterioară).
--fire
Setați numărul maxim de fire paralele (pentru fire POSIX și OpenMP).
Intrare Opţiuni
--b0count
Numărul de imagini b=0 la începutul listei de imagini. Acestea nu sunt incluse în
detectarea sau mascarea slice proastă, dar sunt, de asemenea, scrise în directorul de ieșire pentru
comoditatea. Se presupune că toate imaginile b=0 sunt la începutul listei de
imagini de intrare, dar nu la sfârșit sau la mijloc. [Mod implicit: 0]
--orientare-slice
Definiți orientarea secțiunii a imaginilor de difuzie. Valori acceptate: „axial”,
„sagital”, „coronal”, „slice-x”, „slice-y”, „slice-z”, unde implicit este „axial”,
sau utilizați una dintre următoarele:
--axial
Felii axiale [Acest is il Mod implicit]
--sagital
Felii sagitale
--coronal
Felii coronale
--felie-x
Axa de coordonate X este direcția feliei
--slice-y
Axa de coordonate Y este direcția feliei
--slice-z
Axa de coordonate Z este direcția feliei [Acest is il Mod implicit]
Rău Felie Detectare
--stdev
Pragul pentru identificarea proastă a feliei în unități de intensitate abateri standard peste
toate feliile corespunzătoare din imaginile de difuzie rămase. [Mod implicit: 3]
producție Opţiuni
--schimba in
Tip de date scalare pentru imaginile de ieșire. Dacă valoarea de umplutură este negativă, dar dvs
date de intrare nesemnate, de exemplu, asigurați-vă că selectați un tip de date semnate pentru
ieșire. În mod implicit, tipul de date de ieșire este același cu tipul de intrare. Sprijinit
valori: „char”, „byte”, „short”, „ushort”, „int”, „uint”, „float”, „double” sau use
una dintre următoarele:
--car
8 biți, semnat
--octet
8 biți, nesemnați
--mic de statura
16 biți, semnat
--scurt
16 biți, nesemnați
--int
32 de biți semnat
--uint
32 de biți nesemnați
--pluti
32 de biți virgulă mobilă
--dubla
64 de biți virgulă mobilă
--padding-value , -p
Valoarea de umplere pentru a înlocui datele secțiunilor rele detectate în imaginile de ieșire. [Mod implicit: -unu]
--directorul de ieșire , -o
Calea sistemului de fișiere pentru scrierea imaginilor cu secțiuni proaste mascate (adică, umplute cu a
valoarea de umplutură). [Mod implicit: NICI UNUL]
AUTORI
Torsten Rohlfing, cu contribuții de la Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff și Yaroslav Halchenko
Utilizați cmtk-dwi_mask_bad_slices online folosind serviciile onworks.net