This is the command dbifastae that can be run in the OnWorks free hosting provider using one of our multiple free online workstations such as Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator or MAC OS online emulator
PROGRAM:
NUME
dbifasta - Index a fasta file database
REZUMAT
dbifasta -dbname şir -idformat listă -director director -nume de fișiere şir
-eliberare şir -Data şir -câmpuri listă -exclude şir -maxindex întreg
-opțiuni de sortare şir -systemsort boolean -a curăța boolean -outfile outfile
-indexoutdir outdir
dbifasta -Ajutor
DESCRIERE
dbifasta este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul(e) de comenzi „Utils:Database indexing”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-dbname şir
-idformat listă
Valoare implicită: idacc
-director director
Valoare implicită: .
-nume de fișiere şir
Valoare implicită: *.dat
Necesar secțiune
-eliberare şir
Valoare implicită: 0.0
-Data şir
Valoare implicită: 00/00/00
Avansat secțiune
-câmpuri listă
Valoare implicită: conform
-exclude şir
-maxindex întreg
-opțiuni de sortare şir
Opțiuni de sortare, de obicei „-T ”. pentru a utiliza directorul curent pentru fișierele de lucru și „-k 1,1” pentru
forțați sortarea GNU să folosească primul câmp Valoare implicită: -T . -k 1,1
-systemsort boolean
Valoarea implicită: Y
-a curăța boolean
Valoarea implicită: Y
producție secțiune
-outfile outfile
-indexoutdir outdir
Valoare implicită: .
Use dbifastae online using onworks.net services