Aceasta este comanda domainrepe care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
domainrep - Reordonați fișierul DCF pentru a identifica structurile reprezentative.
REZUMAT
domeniurep -dcfinfile infile -nodul listă -dcfoutfile outfile
domeniurep -Ajutor
DESCRIERE
domeniurep este un program de linie de comandă de la EMBOSS („The European Molecular Biology Open
Suita de software”). Face parte din grupul (grupurile) de comandă „Proteine: Structură 3D”.
OPŢIUNI
Intrare secțiune
-dcfinfile infile
Această opțiune specifică numele fișierului DCF (fișier de clasificare a domeniului) (input). A
„fișierul de clasificare a domeniilor” conține clasificare și alte date pentru domeniile de la
SCOP sau CATH, în format DCF (asemănător EMBL). Fișierele sunt generate utilizând SCOPPARSE
și CATHPARSE. Informațiile despre secvența domeniului pot fi adăugate la fișier utilizând
DOMENIUSEQS.
Necesar secțiune
-nodul listă
Această opțiune specifică nodul înainte de a reordona fișierul. Recomandarea se poate face pentru
orice nod specificat în ierarhiile SCOP sau CATH. De exemplu, selectând „Clasă”
înscrierile aparținând aceleiași clase vor fi reordonate pe rând. Valoare implicită: 1
producție secțiune
-dcfoutfile outfile
Această opțiune specifică numele fișierului DCF (fișier de clasificare a domeniului) (ieșire). A
„fișierul de clasificare a domeniilor” conține clasificare și alte date pentru domeniile de la
SCOP sau CATH, în format DCF (asemănător EMBL). Fișierele sunt generate utilizând SCOPPARSE
și CATHPARSE. Informațiile despre secvența domeniului pot fi adăugate la fișier utilizând
DOMENIUSEQS. Valoare implicită: test.scop
Utilizați domainrepe online folosind serviciile onworks.net
