Aceasta este comanda gap4 care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
gap4 - Programul de asamblare a genomului (parte a pachetului Staden)
REZUMAT
decalaj4 [-ro] [-maxseq ] [-maxdb ] [-skip_notes] [DATABASE_NAME.V]
DESCRIERE
Gap4 este un program de asamblare a genomului. Programul conține toate instrumentele care ar fi
așteptat de la un program de asamblare plus multe caracteristici unice și un foarte ușor de utilizat
interfata. Versiunea originală a fost descrisă în Bonfield,JK, Smith,KF și Staden,R. A
noul program de asamblare a secvenței ADN. Acizi nucleici Res. 24, 4992-4999 (1995)
Gap4 este foarte mare și puternic. Toată lumea folosește un subset de opțiuni și le are
modalitatea preferată de accesare și utilizare a acestora. Deși există o mulțime, utilizatorii sunt
încurajat să parcurgă întreaga documentație o dată, doar pentru a descoperi ce este
posibil și modul care se potrivește cel mai bine propriei lor lucrări. Cel puțin, toate acestea
capitolul introductiv trebuie citit, deoarece pe termen lung, se va economisi timp.
OPŢIUNI
-ro Numai în citire
-maxseq N
Lungimea totală maximă inițială a consensului
-maxdb N
Număr maxim inițial de contigs + citiri
-(nu_)verifica
(Nu) rulați Check Database la deschiderea DB
-(no_)exec_notes
(Nu) executați note OPEN/CLOS la deschiderea bazei de date
-(no_)rawdata_note
(Nu) utilizați nota RAWD în loc de RAWDATA env. variabil
-(nu_)csel
(Nu) porniți selectorul contig la deschiderea db
-afişa
X Display de utilizat
-bitsize N
Specifică dimensiunea fișierului auxiliar pentru noile baze de date (32/64)
-sincronizare Utilizați modul sincron pentru serverul de afișare (depanare)
-- Sfârșitul listei de argumente
Utilizați gap4 online folosind serviciile onworks.net
