gdcm2vtk - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

gdcm2vtk - Convertiți un fișier acceptat de VTK în DICOM.

REZUMAT

gdcm2vtk [opțiuni] fișier-in-fișier-out

DESCRIERE

gdcm2vtk ia ca intrare orice fișier suportat de VTK (inclusiv fișierul DICOM) și va
generați ca ieșire un fișier DICOM.

PARAMETRI

nume de fișier de intrare de intrare (acceptat DICOM sau VTK)

nume de fișier de ieșire pentru ieșire fișier (acceptat DICOM sau VTK)

OPŢIUNI

specific Opțiuni
--force-rescale forța redimensionare.
--force-spacing spațierea forțelor.
--palette-color atunci când este acceptat generează un fișier PALETTE COLOR.
--argb când este acceptat generează un fișier ARGB.
--compress atunci când este acceptat generează un fișier comprimat.
--use-vtkdicom Utilizați vtkDICOMImageReader (în loc de GDCM).
--modality set Modalitate.
--lower-left set jos stânga.
--shift set shift.
--scale set scale.
--comprimați compresia setată (MetaIO).
-T --study-uid Studiu UID.
-S --series-uid Serie UID.
--root-uid UID rădăcină.

comprimare Opțiuni
-J --jpeg Comprimați imaginea în jpeg.
-K --j2k Comprimați imaginea în j2k.
-L --jpegls Comprimați imaginea în jpeg-ls.
-R --rle Comprimați imaginea în rle (numai fără pierderi).

general Opțiuni
-h --ajutor
imprimați acest text de ajutor și ieșiți

-v --versiune
imprimați informațiile despre versiunea și ieșiți

-V --verbos
modul verbos (avertisment+eroare).

-W --avertisment
modul de avertizare, imprimați informațiile de avertizare

-E --eroare
modul de eroare, imprimați informații despre eroare

-D --depanare
modul de depanare, imprimați informațiile de depanare

mediu inconjurator variabil
GDCM_ROOT_UID UID rădăcină

DESCRIERE

Convertiți un fișier acceptat de VTK în DICOM.

Utilizarea tipică este:

$ gdcm2vtk inputfile output.dcm

Utilizează mecanismul intern din fabrică al VTK pentru a recunoaște un fișier (funcția CanRead). Vedea
Fișierul acceptat VTK aici:

Ce formate de fișiere imagine poate citi și scrie VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Dacă fișierul de intrare are 4 componente, a 4-a comp (alfa) va fi eliminată din ieșire
Fișierul deoarece DICOM nu mai acceptă componenta alfa (vezi opțiunea –argb).

A fost acordată o atenție deosebită următorului format de fișier:

1. DICOM: Cosinus de direcție și vtkMedicalImageInformation sunt transmise la ieșire
2. BMP: Fișierul poate fi salvat cu un tabel de căutare (vezi --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties este transmis la ieșire
4. MINC: Cosinus de direcție este transmisă la ieșire
5. TIFF: vtkTIFFReader este în prezent în stare proastă în VTK (comportament diferit în VTK 5.2 și git/master). Folosește-l doar dacă știi ce faci.

CONVERT MetaImage (mhd, mha)
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

Această comandă va converti fișierul DICOM de intrare: fișierul de intrare într-un fișier MetaImage .mha. La fel
merge pentru fișierul .mhd.

CONVERT MHA/MHD
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

or

$ gdcm2vtk inputfile output.mhd

Această comandă va converti fișierul DICOM de intrare: fișierul de intrare într-un MetaImageData .mha/.mhd
fișier.

CONVERT VTI
$ gdcm2vtk inputfile output.vti

Această comandă va converti fișierul DICOM de intrare: fișierul de intrare într-un XML VTK ImageData .vti
fișier.

CONVERT VTK
$ gdcm2vtk inputfile output.vtk

Această comandă va converti fișierul DICOM de intrare: fișierul de intrare într-un vechi VTK Structured
Fișierul PointSets .vtk.

CONVERT SPUN

$ gdcm2vtk input.dcm output.dcm

vtkGDCMImageReader va fi folosit pentru a citi într-un fișier DICOM, nu cel implicit
vtkDICOMImageReader. Consultați opțiunea –use-vtkdicom pentru a utiliza vtkDICOMImageReader.

DUS-ÎNTORS SPUN LA MHD LA SPUN

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 output.mhd output.dcm

Secțiunea de mai sus arată cum se convertește un DICOM utilizând interpretarea fotometrică a
YBR_FULL (sau chiar YBR_FULL_422 are pierderi) într-un alt format de fișier: MetaImage (mhd). De cand
acest format de fișier nu gestionează spațiul de culoare, trebuie să-l setăm în mod explicit folosind
–opțiune de linie de comandă format imagine. Opțiunea de linie de comandă –modality este necesară în acest sens
caz, deoarece familia implicită Secondary Capture Image Storage Class nu permite YBR
Interpretare fotometrică.

GDCM2VTK NOTE

NOTĂ IMPORTANTĂ: VTK-ul intern structurat va fi completat de la intrarea DICOM, apoi
treceți la scriitorul DICOM de ieșire. Unele informații se pot pierde în timpul conversiei
DICOM la VTK la DICOM. Această opțiune este folosită mai ales pentru a testa
Combinația vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter.

NOTĂ IMPORTANTĂ: Când faceți conversia dintr-un format cu pierderi, cum ar fi JPEG, informațiile despre
pierderea este importantă. Ieșirea DICOM va conține imaginea cu pierdere necesară
Atribut de compresie care indică că imaginea a fost comprimată cu pierderi undeva de-a lungul
conductă. A se vedea, de asemenea, gdcmimg (manipulare mai bună a JPEG în general).

NOTĂ IMPORTANTĂ: Când utilizați –use-vtkdicom, fișierul DICOM de ieșire va fi întotdeauna scris ca
Stocarea imaginilor MR, deoarece aceste informații nu sunt disponibile de la cititor însuși. Acest lucru permite
setarea corectă a orientării imaginii (pacient).

Utilizați gdcm2vtk online folosind serviciile onworks.net