Aceasta este comanda glam2scan care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
glam2scan - găsește un motiv GLAM2 într-o bază de date
REZUMAT
glam2scan [Opțiuni] alfabet my_motiv.glam2 my_seqs.fa
Un alt alfabet decât p or n este interpretat ca numele unui fișier alfabetic.
DESCRIERE
glam2scan găsește potriviri, într-o bază de date de secvențe, cu un motiv descoperit de glam2. Fiecare
meciul primește un scor, indicând cât de bine se potrivește motivului.
OPŢIUNI (MOD IMPLICIT SETĂRI)
-h
Afișați toate opțiunile și setările lor implicite.
-o
Fisier de iesire (stdout).
-n
Numărul de aliniamente de raportat (25).
-2
Examinați ambele fire - complement înainte și invers.
-D
Pseudocount de ștergere (0.1).
-E
Pseudocount fără ștergere (2.0).
-I
Pseudonumăr de inserții (0.02).
-J
Pseudonumăr fără inserare (1.0).
-d
Dosar amestec Dirichlet.
Utilizați glam2scan online folosind serviciile onworks.net