Aceasta este comanda gmod_fasta2gff3.plp care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
$O - Convertiți FASTA în GFF3 simplu
SINOPSIE
% $O [opțiuni]
LINIE DE COMANDA OPŢIUNI
--fasta_dir Directorul conține fișiere fasta
(implicit: ./fasta)
--gfffilename Numele fișierului GFF3 care urmează să fie creat
(implicit: ./out.gff)
--type SO type de atribuit fiecărei caracteristici
(implicit: EST)
--source Text care va apărea în coloana sursă
(Mod implicit: .)
--attributes Perechi suplimentare tag=valoare care vor apărea în coloana 9
--nosequence Suprima secțiunea ##FASTA (adică, nu
tipăriți secvențe de ADN)
DESCRIERE
Acest script ia pur și simplu o colecție de fișiere fasta și le convertește în GFF3 simplu
potrivit pentru încărcare în chado.
AUTORI
Scott Cain[e-mail protejat]>
Drepturi de autor (c) 2006
Această bibliotecă este software gratuit; îl puteți redistribui și/sau modifica sub același
termeni ca Perl însuși.
Utilizați gmod_fasta2gff3.plp online folosind serviciile onworks.net