Aceasta este comanda gt-gff3validator care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
gt-gff3validator - Validați strict fișierele GFF3 date.
REZUMAT
gt gff3validator [opțiune ...] [GFF3_file ...]
DESCRIERE
-verificare de tip [şir]
utilizați o ontologie dată într-un fișier OBO pentru a valida relațiile părinte-copil. Daca nu
este dat, fișierul sofa.obo din directorul gtdata/obo_files este folosit. Dacă
este dat un argument, acesta este folosit ca nume de fișier OBO. În cazul în care un astfel de dosar o face
nu exista .obo se adaugă la argument și se încarcă numele fișierului rezultat din
Directorul gtdata/obo_files este încercat. (implicit: nedefinit)
-xrfcheck [şir]
verificați atributele Dbxref și Ontology_term pentru sintaxa corectă conform a
fișier de definiție a abrevierilor. Dacă nu este dat niciun argument, fișierul GO.xrf_abbs din
Se folosește directorul gtdata/xrf_abbr. Dacă este dat un argument, acesta este folosit ca specific
nume de fișier pentru un fișier de abreviere. În cazul în care un astfel de dosar nu există,
.xrf_abbr se adaugă la argument și se încarcă numele fișierului rezultat din
Directorul gtdata/xrf_abbr este încercat. (implicit: nedefinit)
-Ajutor
afișați ajutor și ieșiți
-versiune
afișați informații despre versiune și ieșiți
RAPORTAREA GANDACI
Raportați erori la[e-mail protejat]>.
Utilizați gt-gff3validator online folosind serviciile onworks.net
