Aceasta este comanda gt-uniq care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
gt-uniq - Filtrați graficele repetate ale nodurilor caracteristice într-un fișier GFF3 sortat.
REZUMAT
gt unic [opțiune...] [fișier_GFF3]
DESCRIERE
-v [da|nu]
fie verbos (implicit: nu)
-o [nume de fișier]
redirecționează rezultatul către fișierul specificat (implicit: nedefinit)
-gzip [da|nu]
scrieți fișierul de ieșire comprimat gzip (implicit: nu)
-bzip2 [da|nu]
scrieți fișierul de ieșire comprimat bzip2 (implicit: nu)
-forta [da|nu]
forțați scrierea în fișierul de ieșire (implicit: nu)
-Ajutor
afișați ajutor și ieșiți
-versiune
afișați informații despre versiune și ieșiți
O parcurgere în profunzime a unui grafic de nod de caracteristică începe de la nodul de caracteristică de nivel superior (sau
pseudo-nod) și explorează cât mai departe posibil de-a lungul fiecărei ramuri înainte de a da înapoi. hai sa
presupunem că nodurile caracteristice sunt stocate într-o listă în ordinea parcurgerii lor (numită
„lista de noduri de caracteristici”).
Două grafice de noduri de caracteristici sunt considerate a fi repetate dacă lista lor de noduri de caracteristici (din
traversarea adâncime-primă) au aceeași lungime și fiecare pereche de noduri de caracteristică (din ambele liste la
aceeași poziție) este „similar”.
Două noduri de caracteristică sunt „similare”, dacă au același ID de secvență, tip de caracteristică, interval,
fir și fază.
Pentru un astfel de nod de caracteristică repetat, graficați cel cu scorul mai mare (al nivelului superior
caracteristică) este păstrată. Dacă doar unul dintre graficele nodurilor caracteristice are un scor definit, acesta este
ținut.
RAPORTAREA GANDACI
Raportați erori la[e-mail protejat]>.
Utilizați gt-uniq online folosind serviciile onworks.net