Aceasta este comanda hmm-assembler.pl care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
hmm-assembler.pl - modul SNAP hmm-assembler.pl
REZUMAT
hmm-asamblator.pl [-OPȚIUNI [-MAI MULTE OPȚIUNI,--] [PROGRAM_ARG1 ...]
OPŢIUNI
următor un singur caracter Opțiuni sunt admis:
Cu argumente: -i -e -A -D -M -S -C -I -N -a -3 -5 -Z -c
Boolean (fără argumente): -r -o -x -p -t -1
Opțiunile pot fi îmbinate împreună. -- oprește procesarea opțiunilor. Nu este necesar spațiu
între opțiuni și argumentele lor.
Opțiuni:
-i [500]
-e [1000]
-A [0:30]
-D [0:9]
-M [0:15]
-S [0:9]
-C [4]
-I [4]
-N [4]
-3 [] include modelul 3'UTR, necesită -a
-a [] include modelul PolyA, necesită -3
-5 [] include 5'UTR moel, necesită -p
-p include modelul promotor generic, necesită -5
-r include modelul generic de repetare
-o include modelul ORF invers
-x utilizați modelul de intron cu durată explicită
-t includ C.elegans trans-splicing, necesită -p, -5
-Z stabilește valori specifice cladelor (vierme, muscă, plantă)
-1 model cu o singură genă
-c
includ modelul donor de îmbinare GC-AG
Utilizați hmm-assembler.pl online folosind serviciile onworks.net