Aceasta este comanda indigo-deco care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
indigo-deco - detectarea schelei molecule și deconvoluția grupului R
REZUMAT
indigo-deco fișiere [parametrii]
indigo-deco -h
DESCRIERE
indigo-deco realizează detectarea schelei de molecule și deconvoluția grupului R. Admis
formatele sunt: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES și CML.
OPŢIUNI
indigo-deco acceptă următorii parametri.
-h Imprimați mesajul de ajutor
-a Calculați schela aproximativă (implicit este exact)
-s
Scrieți schela maxim găsită în molfile
-S
Scrieți toate schelele găsite în fișierul SD
-l
Nu calculați schela, ci încărcați-l din fișier
-sr
Scrieți schelă cu site-uri R într-un fișier
-o
Scrieți moleculele evidențiate rezultate pe dosar
-r
Scrieți moleculele rezultate cu grupuri r separate în fișier
creat Fără considerație aromatică
-- Marchează sfârșitul opțiunilor
EXEMPLE
indigo-deco *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
Citiți molecule din fișierele mol din directorul curent, salvați schela maximă găsită
la scaf.mol și salvați moleculele evidențiate în hl.sdf.
indigo-deco structura.mol multe.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
Citiți o moleculă din structura.mol și mai multe molecule din many.sdf, economisiți
moleculele cu r-rgoups la rg.sdf și salvați toate schelele găsite în allscafs.sdf.
indigo-deco *.smi -d readyscaf.mol -o hl.sdf
Citiți mai multe molecule din fiecare fișier SMILES din directorul curent, citiți
schelă de la readyscaf.mol și salvați moleculele evidențiate în hl.sdf.
Utilizați indigo-deco online folosind serviciile onworks.net
