Aceasta este comanda kmc_tools-union care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
kmc_tools-union - calculează unirea a două baze de date KMC
REZUMAT
kmc_tools uniune
DESCRIERE
Baza de date de ieșire va conține toți k-merii prezenți în ambele seturi de intrare. Pentru același
k-meri în prima și a doua intrare, contorul din ieșire este egal cu suma
de la ambele intrări.
OPŢIUNI
Pentru fiecare intrare există parametri suplimentari:
-ci
excludeți k-merii care apar mai puțin de ori
-cx
excludeți k-merii care apar mai mult decât ori
Pentru ieșire există parametri suplimentari:
-ci
excludeți k-merii care apar mai puțin de ori
-cx
excludeți k-merii care apar mai mult decât ori
-cs
valoarea maximă a unui contor
EXEMPLU
kmc -k28 fișier1.fastq kmers1 tmp kmc -k28 fișier2.fastq kmers2 tmp kmc_tools union kmers1
-ci3 -cx70000 kmers2 kmers1_kmers2_union -cs65536
Utilizați kmc_tools-union online folosind serviciile onworks.net
